Есть разница без фильтров и выключение фильтра.
Без фильтра тоже создается баланс, но дольше (новичкам не рекомендую), в грунте бактерии, растения поглощают, в общем экосистема. А вот когда включаете-выключаете, бактерии начинают погибать через два часа, ночь 8 часов и сколько погибших? отсюда...